豬瘟口蹄疫(CSFV/FMDV-U)熒光PCR檢測試劑盒說明書
【產(chǎn)品名稱】
商品名稱:豬瘟病毒/口蹄疫病毒通用型(CSFV/FMDV-U)核酸檢測試劑盒(實時熒光-PCR 法)
英 文 名 :Genomic acid detection kit for CSFV/FMDV-U (real-time fluorescence-PCR)
【包裝規(guī)格】48T/盒
【預期用途】
豬瘟病毒/口蹄疫病毒通用型(CSFV/FMDV-U),是由A型流感病毒引起禽類的一種從呼吸系統(tǒng)到嚴重全身敗血癥等多種癥狀的傳染病[1]。其中CSFV/FMDV-U,不僅可以感染禽類,也可以感染人類,特別是1999年以來,H9N2亞型AIV感染人事件的多次發(fā)生[2-3]嚴重威脅了人類健康、畜牧業(yè)生產(chǎn)和畜產(chǎn)品的貿(mào)易,其公共衛(wèi)生意義已引起*的廣泛關(guān)注[4]。本試劑盒利用實時熒光PCR原理,定性、定量檢測CSFV/FMDV-U,對CSFV/FMDV-U引起的流感診斷有重要指導意義。
【檢驗原理】
本試劑盒針對CSFV/FMDV-U 基因高度保守區(qū)域設計特異性引物和探針, 在反應體系中含基因組模板的情況下,PCR反應得以進行并釋放熒光信號。利用儀器對PCR過程中相應通道的信號強度進行實時監(jiān)測和輸出,實現(xiàn)檢測 結(jié)果的定性、定量分析。
【試劑組成】
名 稱 規(guī) 格
酶液 50μL×1 管
AIV-H9 反應液 1.0mL×1 管
AIV-H9 陽性質(zhì)控品 50μL ×1 管
陰性質(zhì)控品 250μL ×1 管
注:
1)不同批號試劑不能混用。
2)試劑盒內(nèi)各試劑組份足夠包裝規(guī)格所標示的檢測次數(shù)。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運輸、反復凍融次數(shù)不超過 5 次,有效期 12 個月。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫 MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、Eppendorf 等系列熒光定量 PCR 檢測儀。
【標本采集】
病死或撲殺禽,取喉氣管、腦、胸肌、心肌和肺等組織;待檢活禽,用棉拭子取呼吸道分泌物或排泄物,置于 1mL 50%甘油生理鹽水中。
【保存和運輸】
上述標本短期內(nèi)可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過 6 個月,標本運送應采用 2~8℃冰袋運輸,嚴禁反復凍融。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
每份組織分別從 3 個不同的位置稱取樣品約 1g,手術(shù)剪剪碎混勻后取 0.5g 于研磨器中研磨,加入 1.5mL 生理鹽水后繼續(xù)研磨,待勻漿后轉(zhuǎn)至 1.5mL 滅菌離心管中,
8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中;棉拭子直接取 100
μL 于 1.5mL 滅菌離心管中。
1.2RNA 提取
推薦采用上海晅科生物科技有限公司生產(chǎn)的RNA 提取試劑盒(離心柱提取法),請按照試劑盒說明書進行操作。
2.試劑配制(試劑準備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設所需要的 PCR 反應管管數(shù)為 N(N=樣本數(shù)+1 管陰性對照+1 管陽性對照;樣品每滿 7 份,多配制 1 份),每測試反應體系配制如下表:
試劑 AIV-H9 反應液 酶液
用量 20μL 1μL
將混合好的測試反應液分裝到 PCR 反應管中,21uL/管。
3.加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的 RNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取 4μL,分別加入相應的反應管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4.PCR 擴增(核酸擴增區(qū))
4.1將待檢測反應管置于熒光定量 PCR 儀反應槽內(nèi);
4.2
熒光通道選擇: 檢測通道(Reporter Dye) FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)
NONE,ABI 系列儀器請勿選擇 ROX 參比熒光,選擇 None 即可。
4.3推薦循環(huán)參數(shù)設置:
步驟 循環(huán)數(shù) 溫度 時間 收集熒光信號
1 1 cycle 42℃ 20min 否
2 1 cycle 95℃ 10min 否
3 40 cycles 94℃ 15sec 否
55℃ 30sec 是
5.結(jié)果分析判定
5.1結(jié)果分析條件設定
設置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機器自動分析的結(jié)果分析,當曲線出現(xiàn)整體傾斜時,根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié) Baseline 的start 值(一般可在 3~15 范圍內(nèi)調(diào)節(jié))、
stop 值(一般可在 5~20 范圍內(nèi)調(diào)節(jié)),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結(jié)果。
5.2結(jié)果判斷
陽性:檢測通道 Ct 值≤35.0,丏明顯的擴增曲線。
可疑:檢測通道 Ct 值>35.0,丏出現(xiàn)明顯曲線的樣本建議重復試驗,重復試驗結(jié)果如果同樣出現(xiàn) Ct 值≤35.0 和明顯擴增曲線則為陽性,否則為陰性。
陰性:樣本檢測結(jié)果無 Ct 值丏無明顯的擴增曲線。
6.質(zhì)控標準
陰性質(zhì)控品:無明顯擴增曲線丏無 Ct 值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴增曲線有明顯指數(shù)生長期,丏 Ct 值≤32; 以上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
7.檢測方法的局限性
Ø樣本檢測結(jié)果不樣本收集、處理、運送以及保存質(zhì)量有關(guān);
Ø樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現(xiàn)假陽性結(jié)果;
Ø陽性對照、擴增產(chǎn)物泄漏,會導致假陽性結(jié)果;
Ø病原體在流行過程中基因突變、重組,會導致假陰性結(jié)果;
Ø不同的提取方法存在提取效率差異,會導致假陰性結(jié)果;
Ø試劑運輸,保存不當或試劑配制不準確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測不準確的結(jié)果;
【注意事項】
Ø所有操作嚴格按照說明書進行;
Ø試劑盒內(nèi)各種組分使用前應自然融化,*混勻并短暫離心;
Ø反應液應避光保存;
Ø反應中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
Ø使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)與用工作服;
Ø樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進行,以免交叉污染;
Ø實驗完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
Ø試劑盒里所有物品應視為污染物對待,并按照《微生物生物醫(yī)學實驗室生物安全通則》進行處理。
【參考文獻】
[1]WEBSTER R G, BEAN W J, GORMA N O T, et al. Evolution and ecology of influenza A viruses [J] . Microbiol Rev, 1992, 56(1): 152 -179.
[2]GUO Y J, KRAUSS S, SENNE D A, et al. Characterization of the pathogenicity of members of the newly established H9N2 influenza virus lineages in Asia
[J] .Virology, 2000, 267( 2):279 -288.
[3]唐秀英, 付朝陽, 馮菊艷. H9 亞型禽流感的流行不防制[J] . 預防獸醫(yī)學進展, 2000, 2( 4): 1-3.
[4]郭元吉, 李建國, 程小雯, 等. 禽 H9N2 亞型流感病毒能感染人的發(fā)現(xiàn)[J] . 中華實驗和臨床病毒學雜志, 1999, 13( 2): 105-108.
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